5 января 1998 года в соответствии с Указом Президента Туркменистана № 3479 в результате слияния Национального музея истории и этнографии Туркменистана и Музея изобразительных искусств Туркменистана был создан Национальный музей Туркменистана. Музей открылся 12 ноября 1998 года. Музей состоит из семи постоянно действующих галерей, посвященных истории, современной культуре и этнографии Туркменистана.
Указом Президента Туркменистана Гурбангулы Бердымухамедова от 21 февраля 2007 года No 8270 по обе стороны от Национального музея началось строительство Музея Президента Туркменистана и Музея этнографии и краеведения. 14 мая 2009 года Указом Президента Национальный музей Туркменистана был переименован в Главный национальный музей Туркменистана. 18 мая 2009 года состоялась церемония открытия Музея этнографии и краеведения Главного национального музея Туркменистана, а 29 июня 2009 года – Музея Президента Туркменистана. С 2009 по 2013 год он был назван главным национальным музеем Туркменистана.
В апреле 2013 года он вошел в состав Государственного культурного центра Туркменистана и был переименован.
В музее насчитывается более 130 000 экспонатов. В музее собраны тысячи археологических памятников из Старого Нусаяна и Древнего Мерва. В музее собраны коллекции старинных туркменских ковров, редкие образцы национальной одежды и тканей, обычная мебель, предметы из драгоценных металлов, оружие, призы.
Музей Президента Туркменистана состоит из трех этажей, два из которых увековечивают историю развития государства со дня приведения к присяге Президента Гурбангулы Бердымухамедова. Экспозиция музея разделена на 10 разделов, в которых представлены пожертвования населения, иностранных граждан, бизнес-групп и иностранных государственных чиновников.
