В XV–XVII веках большинство туркменов начали селиться в окрестностях озера. Исследования различных учёных показывают, что река Джейхун была единственным источником питания озера Сарыкамыш, а некоторые исследования предполагают, что воды реки Джейхун начали полностью впадать в Аральское море. Это событие произошло в XVII веке. Со временем люди, поселившиеся на берегу озера, были вынуждены покинуть свои дома, поскольку площадь озера сократилась и оно высохло. В 1971 году, для поддержки советских сельскохозяйственных проектов, были проложены каналы из Хорезма (Узбекистан) для питания озера Сарыкамыш, что позволило сохранить тектонические отложения Сарыкамыша в качестве озера, не давая им пересыхать.
